После бурных событий начала 17 в. пострадавшие от натиска неприятия старые стены были разобраны в 1620-1660 г.г. Одновременно со стенами возводились и башни. Одной из первых в 17 в. была сооружена Богородицкая башня — в1623 году. Из шести монастырских крепостных башен 17 в. до настоящего времени сохранились две — Богородицкая и Угличская. В1896 году в Богородицкой башне устроили Троицкую часовню в память пребывания в монастыре Михаила Федоровича Романова. В ней поставили икону Симеона Богоприимца с частицей мощей святого.