В середине 60-х годов прошлого века группой энтузиастов, в их числе были Федотов Л.Н. и Иванова К.А., был начат сбор экспонатов для будущего музея.
Годом основания музея считается 1967 год – год, когда музей начал свою работу, несмотря на то, что постоянного помещения у него тогда ещё не было. Но уже был музейный фонд и огромное желание показывать собранный материал.
Статус муниципального учреждения музей получил лишь три года спустя — 12 июня 1970 года. В официальном документе об его создании целью деятельности нового учреждения были определены «активизации изучения истории родного края, воспитание любви к Родине, уважения к труду, боевым заслугам наших земляков»
Иванову Клавдию Алексеевну назначают первым директором музея, для которого выделяют старое деревянное, двухэтажное здание на улице Свердлова. В новом музее вовсю кипела исследовательская и просветительная работа. Создается Совет музея, в который вошли заведующий городским архивом, специалист по охране памятников при горисполкоме, заведующий школьными музеями, специалисты из туристического бюро и Дома пионеров, а также местные художники и председатели городского Совета ветеранов войны и Общества книголюбов. Председателем Совета музея стал начальник вневедомственной охраны Иван Антонович Несин, им была бесплатно установлена сигнализация. Музей систематически пополнялся новыми историческими экспонатами, которые легли в основу первых экспозиций по истории города: «Бердск до революции», «Борьба за советскую власть», «Довоенные пятилетки», «Великая Отечественная война», «Новый Бердск», «Бердск сегодня». В их оформлении принимала активное участие художественная мастерская Бердского радиозавода под руководством Беллы Михайловны Арбит. Выставка работ художников этой мастерской и самой Б. М. Арбит была размещена на втором этаже музея.
После выхода на пенсию К.А. Ивановой директорами музея работали Нина Николаевна Аносова, Надежда Афанасьевна Савоненко.
С 1980 года сотрудником О.Г.Ладик начинается формирование художественного фонда музея. Основу коллекции составили картины, переданные Государственным музейным выставочным центром «РОСИЗО».
В мае 1988 года при поддержке общественности и лично председателя Совета ветеранов войны Медведева Е.Е. музей переезжает в новое здание по ул. Спортивная,9, где располагается до сих пор. И с этого года музей становится «историко-художественный». Директором музея назначена Наталья Алексеевна Стародубова.
Из 720 кв.м новых помещений музея, 307 кв.м было занято под экспозиции и выставки, 25,8 кв.м — под хранение фондов, которые не переставали пополняться. Коллекция экспонатов по Великой Отечественной войне существенно пополнилась благодаря активной работе начальника Поста №1 Мельникова Ивана Андреевича.
В 1991 году музей возглавил Валерий Борисович Веселовский, ранее руководивший музеем школы № 5. Большую часть экспонатов школьного музея В.Б. Веселовский передал в городской музей. Под его руководством начала создаваться археологическая коллекция. Находки, найденные в результате раскопок древних могильников на территории Бердска, вошли в археологическую экспозицию. Художественной мастерской БРЗ оформляются выставочные экспозиции по истории и археологии, которые, несмотря на то, что создавались как «временные», просуществовали более 10 лет.
Принявшие, каждый в свое время, эстафету по руководству музея, директора В.Б. Панченко и В.Н. Шахматова, сделали музей одним из центров культурного просвещения бердчан. Интересные выставки, лектории по истории и искусству, кукольный театр, клуб «Гармония» притягивали посетителей в музейные залы как магнит. Одновременно был поставлен вопрос о переносе музея в центральную часть города, который, увы, так и остался нерешённым.
С 1999 года музеем руководит Пащенко М.Ю., в этот же год городскому музею были переданы фонды заводского музея Производственного объединения «Вега», которая до сегодняшнего дня составляет основу постоянно действующей экспозиции на ул. Ленина, 89/8. В этот же период здание по ул. Спортивной закрывается до 2002 года на капитальный ремонт. А в 2003 году торжественно открывается новая и пока единственная историческая экспозиция музея «Листая Книгу Памяти».
В 2014 году музей после капитального ремонта ввел в эксплуатацию новые помещения по ул.Спортивная, 11, со светлым выставочным залом, хранилищем и рабочими кабинетами.
В 2016 году музей прирос двумя структурными подразделениями: «Дом дружбы» и мемориальным музеем Народного артиста РФ, бердчанина Владлена Бирюкова, названным «Театр Бирюкова». Музей расположился во вновь выделенном помещении по ул.Кирова, 1 , стал единственным мемориальным музеем, посвященным актерам в Новосибирской области и был занесен в «Золотую книгу культуры Новосибирской области», как лучший проект года.
Музей сегодня – это 16,5 тыс. единиц хранения, из которых более 1,5 тыс. — художественный фонд. Ежегодно музейный фонд пополняется 300 музейными предметами. Общая экспозиционная площадь всех музейных залов составляет 893,3 кв.м., из них 209,4 кв. м. — площадь под хранение. Сотрудники музея ведут исследовательскую работу, в т. ч. в государственных архивах получая дополнительные сведения и новые факты биографии г. Бердска. Ежегодно музей проводит более 100 выставок, а также более 150 мероприятий: музейные чтения, творческие встречи, конкурсы, игровые программы, лекции и т.д.
Музей — инициатор многих городских мемориальных проектов по увековечиванию памяти бердчан.
Музей в свои пятьдесят «с хвостиком» полон идей и новый проектов и смело утверждает, что Музей – это лучшее место для встреч и общения!