Торжественная закладка больничной церкви прп. Елисаветы Чудотворицы была совершена в 1860 году. В 1877 году работы по возведению церкви и других построек монастыря были практически завершены, но в их ход вмешалась русско-турецкая война. Все работы были преостановлены. Освящена церковь была в октябре 1879 года прп. Пименом Угрешским. Больничный корпус и больничная церковь связаны сводчатыми галереями с восточной стороной монастырского собора.
Закрыта в феврале 1927 года. Сначала там находился клуб, позднее службы теплосети будущего ОАО «Мосэнерго». Помещение церкви находилось в аварийном состоянии.
Возвращена РПЦ в 1990 году. Реставрирована и освящена в апреле 1995 года.
