На плане монастыря, составленным М.Д. Быковским в 1881 году, часовня Иоанна Предтечи показана в том месте, где и находится поныне. Часовня впервые упоминается при пожаре 1737 года. Закрыта в 1922 году, после изъятия монастырского имущества. В советское время находились службы теплосети. Отремонтирована и открыта в конце 1991 года. В 2002 году в часовню вернулись святыни — точная копия иконы с частицей мощей св. Иоанна Предтечи и медный обруч. Обруч одевается на голову, известен с середины XIX века.