Часовня была построена по личной инициативе в благодарность Богу генерал-майором П.М. Новиковым в 2006 году рядом с кладбищем микрорайона Баганашил. 16 сентября 2008 года, в день памяти священномученика Пимена Верненского, часовню освятил митрополит Астанайский и Алма-Атинский Мефодий.