Церковь появилась в консерватории в 1896 г., когда консерватория получила новое собственное здание на Театральной площади (перестроенное из здания бывшего Большого театра). Высочайшее решение о передаче здания Большого театра в собственность консерватории было принято в 1889 г., в связи с празднованием 50-летия творческой деятельности основателя консерватории Антона Григорьевича Рубинштейна, по ходатайству великой княгини Александры Иосифовны. Перестройка здания продолжалась несколько лет, и только 12 ноября 1896 г. (через два года после смерти Рубинштейна) новое здание с помещавшейся на третьем этаже церковью было торжественно открыто.
Источник: http://nativitas.ru/Skvirskaia
Новая церковь С.-Петербургской консерватории торжественно освящена 18 октября. Обширная церковь, рассчитанная на 350 человек молящихся, отделана в древне-русском стиле и украшена живописью и фресками, напоминающими фрески собора в Ярославле, резной иконостас из мореного дуба. Иконопись в церкви исполнена по эскизам художника Рябушкина. Благодаря громадным окнам церковь залита светом. На стенах исполнены живописные священные изображения. Церковь соединяется складною дверью — стенкою с соседними помещениями, что дает возможность увеличить церковь смотря по количеству молящихся.
«Неделя строителя», 1896, №43, с. 232