Поначалу кладбище на южной окраине столицы, близ старинной деревни Тентелево, между позднейшими Варшавской и Балтийской линиями железной дороги, возникло в 1831 г. как холерное, но затем стало обычным городским, где хоронили в основном простолюдинов. К нему примыкали Громовское старообрядческое кладбище и открытое в 1845 г. финское лютеранское. Перед революцией на православном кладбище стояло три храма. В престольный праздник, 7 августа, сюда для поминовения собиралось до 100 000 горожан.
Свое название кладбище получило по главному храму, посвященному канонизированному в те годы святому. Вначале его предполагалось возвести по образцу Митрофаниевского собора в Воронеже, но утвержденный в 1836 г. проект Лапина оказался чересчур дорогим, и пришлось обратиться к готовому плану К.А. Тона, по которому строилась трехпридельная церковь в Свеаборге, морской крепости под Гельсингфорсом (Хельсинки). Закладка состоялась 1 октября 1839 г., однако строительные работы начались лишь весной следующего года и шли под смотрением К.И. Реймерса. 5 августа 1842 г. произошло обрушение куполов, и руководство работами было поручено опытному А. Адамини. Он разобрал здание до основания. Его сменил Ф. Руска, завершивший к концу 1844 г. постройку вчерне. Три года ушло на отделку, и 17 августа 1847 г. епископ Ревельский Нафанаил освятил новый пятикупольный храм.
1 августа 1858 г. в подвальном этаже был освящен придел во имя святителей московских: Петра, Алексия, Ионы и Филиппа, созданный на деньги старосты Кудрявцева. Здесь находились фамильные захоронения богатых купеческих семей: Сытовых, Русаковых, Дурдиных, Петуховых, а также могила историка Н.К. Шильдера. Украшенные серебряными окладами иконы в главном пятиярусном иконостасе написали известные академические живописцы: П.М. Шамшин, К. Дузи, А.В. Нотбек, А.А. Васильев, К.А. Зеленцов. По эскизам акад. Ф.Г. Солнцева были исполнены иконостас и роспись сводов (ее произвел П.С. Титов). Благолепие интерьеру придавали 14 крестообразных киотов с образами, поднесенными разными лицами.
В 1883–1884 гг. по проекту епархиального зодчего Г.И. Карпова вместо деревянной колокольни была возведена каменная звонница, а также пристройка к алтарю, недалеко от которой был похоронен писатель И.И. Лажечников. Около 30 лет священником храма, имевшего свой приход, был прот. Николай Афанасьевич Ветвеницкий, составивший историю кладбища, а последним перед революцией настоятелем назван прот. Андрей Константинович Бургов.
Митрофаниевская церковь закрыта и снесена в 1929 г., но еще раньше, в мае 1924 г., был закрыт нижний придел, затопленный водой.
http://www.encspb.ru/object/2804677694?dv=2853952566&lc=ru
На Митрофановском городском кладбище три церкви:
— Первая – во имя св. и чудотворца Митрофана, епископа Воронежского, зданием каменная, пятиглавая. Престол в ней один, освященный в 1849 г. В 1858 г. иждивением церковного старосты Галактиона Кудрявцева в подвальном этаже этой церкви устроен придел во имя св. Московских: Петра, Алексия, Ионы и Филиппа.
— Вторая церковь Всемилостивого Спаса деревянная, на каменном фундаменте получила начало в 1835 г. Придельный храм во имя Божией Матери Неопалимая Купина освящен в 1841 г.
— Третья церковь каменная, двухэтажная, с таковою же колокольнею, построена на собственное иждивение коллежского советника Алексея Кекина в 1885 г. В двух этажах два престола: на первом – во имя св. семи Ефесских отроков, во втором этаже – во имя св. Духа.
Причт сей церкви состоит: из 2 протоиереев, 3 священников, 4 диаконов и двух псаломщиков. Священно-церковно-служители имеют помещение в церковных домах; жалования не получают, а довольствуются доходами от исправления церковных треб и процентами с капитала в 30 479 руб., разновременно разными лицами пожертвованных в пользу причта.
Настоятель, протоиерей Евграф Иванович Мегорский… в 1865 г. рукоположен во священника и определен в Новгородский Кадетский Корпус, в 1875 г. определен на должность ректора семинарии и возведен в сан протоиерея, в 1890 г. определен настоятелем сей церкви; имеет ордена: 2-й Анны, 3-й Владимира… Протоиерей Николай Данилович Белороссов… в 1863 г. рукоположен во священника к церкви св. Николая в Брюсселе, при доме посланника, в 1873 г. возведен в сан протоиерея, в 1877 г. определен к сей церкви… Священник Федор Иванович Лукин… рукоположен в 1859 г. во священника к сей церкви… Священник Николай Афанасьевич Ветвеницкий… в 1866 г. рукоположен во священника к сей церкви… Священник Стефан Иванович Чернявский… в 1894 г. рукоположен во священника…
Церковный староста – Спб. 2 гильдии купец Владимир Артемьевич Долгин, утвержден в должности во второе трехлетие в 1891 г. Сиротствующих 13.
«Краткие сведения о церквях и священно-церковнослужителях Санкт-Петербурга» — СПб.: типо-лит. Я. Кровицкого, 1895 г.